施工企业和建设单位之间协商支付工程款是一个涉及多个方面的重要过程，需要双方充分沟通、明确各自的权利和义务，以确保工程顺利进行和双方权益得到保障。以下是从法律角度和施工实践出发，为施工企业和建设单位之间协商支付工程款提供的一些建议：

　　一、明确工程款支付条款

　　在协商支付工程款时，双方应首先明确工程款支付的相关条款。这包括：

　　支付金额：根据工程合同约定的总价款或单价以及实际完成的工程量，确定应支付的工程款金额。

　　支付期限：明确工程款的支付时间和节点，如预付款、进度款、结算款等的支付时间。

　　支付方式：双方可以协商选择直接付款至承包商指定的银行账户、付款给承包商指定的负责人或团队成员、向特定第三方支付款项等支付方式。需要注意的是，选择向特定第三方支付款项时，应确保该第三方与工程合同有直接关联，并明确支付条件和程序。

　　二、制定详细的支付计划

　　为了确保工程款的按时支付，双方应制定详细的支付计划。这包括：

　　预付款计划：在工程开始前，根据合同约定支付一定比例的预付款，以帮助施工企业启动工程。预付款的比例和支付时间应在合同中明确约定。

　　进度款计划：根据工程进度逐步支付工程款。双方应约定工程进度款的支付节点和比例，如每月、每阶段或每项工程完成后支付一定比例的进度款。

　　结算款计划：工程竣工后，双方应按照约定的合同价款及合同价款调整内容以及索赔事项进行工程竣工结算，并明确结算款的支付时间和方式。

　　三、确保支付流程的顺畅

　　在协商支付工程款时，双方还应关注支付流程的顺畅性。这包括：

　　提交申请和审核：施工企业应按照约定的时间和方式向建设单位提交工程款支付申请，并附上相关证明材料。建设单位应及时审核申请材料的真实性和准确性，确保支付流程的顺利进行。

　　开具发票和凭证：施工企业在收到工程款后，应及时开具发票和凭证，以证明款项的合法性和合规性。这有助于双方建立清晰的账务记录，并便于日后的审计和核查。

　　解决支付纠纷：如果在支付工程款过程中出现纠纷，双方应首先通过友好协商的方式解决。如果协商无果，可以寻求法律途径解决争议，如申请调解、仲裁或提起诉讼等。

　　四、注意事项

　　在协商支付工程款时，双方还应注意以下事项：

　　遵守法律法规：双方应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保工程款的支付合法合规。

　　保护商业秘密：在协商过程中，双方应注意保护各自的商业秘密和敏感信息，避免泄露给第三方。

　　建立信任关系：双方应建立长期稳定的信任关系，通过及时沟通、协商解决问题等方式维护良好的合作关系。

　　五、案例分析

　　以某建筑工程项目为例，施工企业和建设单位在协商支付工程款时明确约定了以下条款：

　　预付款为合同总价的10%，在工程开工前一次性支付。

　　进度款按月支付，每月支付当月完成工程量的80%。施工企业需每月末向建设单位提交已完成工程量的报告和支付申请，建设单位在收到申请后7个工作日内完成审核并支付进度款。

　　结算款在工程竣工后3个月内支付完毕。双方按照合同约定的价款及调整内容进行竣工结算，并扣除已支付的预付款和进度款后确定最终支付金额。

　　通过明确的条款和详细的支付计划，该工程项目在工程款支付方面未出现纠纷和问题，确保了工程的顺利进行和双方权益的保障。

　　综上所述，施工企业和建设单位之间协商支付工程款需要双方充分沟通、明确条款、制定计划并关注支付流程的顺畅性。同时，双方还应遵守法律法规、保护商业秘密并建立信任关系，以确保工程款的支付合法合规、顺利进行。