从法律角度来看，建设方(通常指甲方或发包方)对施工方(通常指乙方或承包方)的罚款行为及其在工程款中的扣除问题，需要明确以下几点：

　　一、罚款与违约金的区别

　　首先，需要明确的是，罚款属于行政处罚的一种，只能由行政执法部门依法实施。而建设方与施工方之间签订的是民事合同，双方地位平等，因此建设方并不具备对施工方直接进行罚款的权力。在实际操作中，建设方对施工方的经济处罚往往通过约定违约金的方式来实现。

　　二、违约金的约定与扣除

　　违约金的约定：

　　根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。因此，建设方与施工方可以在施工合同中明确约定违约金条款，以约束施工方的行为。

　　违约金的扣除：

　　当施工方出现违约行为时，建设方有权按照合同约定的违约金条款要求施工方支付违约金。这部分违约金可以在工程款中进行扣除。但需要注意的是，约定的违约金数额应当合理，不得过高或过低，否则可能无法得到法律的支持。如果约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

　　三、法律依据

　　《中华人民共和国民法典》第五百八十五条：关于违约金的约定及其调整的规定。

　　《中华人民共和国行政处罚法》第八条：明确罚款属于行政处罚的一种，只能由行政执法部门依法实施。

　　四、实践中的操作建议

　　明确合同条款：建设方与施工方在施工合同中应明确约定违约金条款，包括违约金的数额或计算方法，以确保在发生违约行为时有明确的依据进行扣款。

　　合理确定违约金数额：约定的违约金数额应当合理，既能体现对施工方违约行为的惩罚性，又不能过分高于实际损失，以避免不必要的法律纠纷。

　　保留相关证据：在施工过程中，建设方应保留与施工方违约行为相关的证据材料，以便在需要时能够证明施工方的违约事实和扣款依据。

　　协商解决纠纷：如果双方对施工方的违约行为及扣款事宜存在争议，应首先通过协商方式解决纠纷。协商不成时，可依法通过仲裁或诉讼途径解决。

　　综上所述，建设方对施工方的经济处罚不能直接以罚款的形式进行，而应通过约定违约金的方式来实现。这部分违约金可以在工程款中进行扣除，但需遵循相关法律法规的规定和合同的约定。