当工程质量不合格时，施工单位应承担的责任主要包括民事责任、行政责任，在特定情况下还可能涉及刑事责任。以下是对施工单位应如何承担责任的详细解读：

　　一、民事责任

　　无偿修理或返工、改建：

　　根据《民法典》第八百零一条的规定，因施工人的原因致使建设工程质量不符合约定的，发包人有权请求施工人在合理期限内无偿修理或者返工、改建。这是施工单位最基本的责任承担方式。

　　赔偿损失：

　　如果因工程质量不合格给发包人或其他第三方造成了损失，施工单位应承担相应的赔偿责任。这包括直接经济损失和间接经济损失，如因工程延期交付导致的额外成本等。

　　违约责任：

　　经过修理或者返工、改建后，如果造成工程逾期交付的，施工单位还应当承担违约责任，包括支付违约金等。

　　二、行政责任

　　责令改正：

　　监管部门有权责令施工单位对不合格的工程进行整改，以达到合格标准。

　　罚款：

　　根据《建筑法》等相关法律法规，施工单位在施工中偷工减料、使用不合格的建筑材料、建筑构配件和设备，或者不按照工程设计图纸和施工技术标准施工的，将面临工程合同价款一定比例(通常为2%以上4%以下)的罚款。

　　降低资质等级或吊销资质证书：

　　对于情节严重、多次出现工程质量问题的施工单位，监管部门有权降低其资质等级或吊销其资质证书，以限制其未来的工程承揽能力。

　　三、刑事责任

　　在极端情况下，如果施工单位的行为构成犯罪(如重大责任事故罪、渎职罪等)，相关责任人员将面临刑事追究，可能被判处有期徒刑、拘役等刑罚。

　　四、具体做法

　　立即停止施工：

　　一旦发现工程质量问题，施工单位应立即停止相关部位的施工，防止问题扩大。

　　组织调查分析：

　　成立专项调查小组，对质量问题进行深入分析，明确责任主体和原因。

　　制定整改方案：

　　根据调查结果，制定详细的整改方案，明确整改措施、责任人和时间节点。

　　实施整改并验收：

　　按照整改方案进行施工整改，完成后邀请相关方进行验收，确保工程质量达到合格标准。

　　总结教训并改进管理：

　　对工程质量问题进行总结反思，查找管理漏洞和薄弱环节，加强内部管理，提高工程质量意识和管理水平。

　　综上所述，施工单位在工程质量不合格时应积极承担责任，通过无偿修理、返工改建、赔偿损失等方式弥补过错，并接受相应的行政和刑事处罚。同时，施工单位还应加强内部管理，提高工程质量意识和管理水平，以避免类似问题的再次发生。