针对员工恶意劳动仲裁的情况，公司应采取一系列综合措施来处理此类问题，以下是具体建议：

　　1. 识别员工恶意劳动仲裁的具体原因和情况

　　具体步骤：

　　详细调查：首先，公司应对员工的仲裁申请进行详细调查，了解其背后的真实动机和依据。这包括审查员工的诉求、收集相关证据，如工作记录、沟通记录等。

　　评估合理性：分析员工的仲裁请求是否合理，是否存在捏造事实、夸大其词或滥用仲裁程序的情况。

　　2. 分析员工恶意劳动仲裁对公司运营和员工权益的影响

　　影响分析：

　　经济影响：公司可能需要支付不必要的赔偿金，增加财务负担。

　　运营影响：劳动仲裁过程可能占用公司管理层的时间和精力，影响正常运营。

　　声誉影响：如果公司被判定存在违法行为，可能损害公众形象和声誉。

　　员工士气：劳动仲裁可能影响员工士气，降低工作积极性和忠诚度。

　　3. 提出针对性的处理措施

　　具体措施：

　　协商与调解：

　　尝试与员工进行协商，了解其诉求，并寻求双方都能接受的解决方案。

　　若协商无果，可请求当地劳动部门或相关调解组织进行调解，以达成和解。

　　积极应诉：

　　如无法避免劳动仲裁，公司应积极配合劳动仲裁部门的工作，提交答辩书并参加仲裁庭审。

　　准备充分的证据材料，证明员工仲裁请求的不合理性，维护公司合法权益。

　　执行裁决：

　　如仲裁裁决对公司不利，公司应依法履行裁决结果，避免进一步的法律纠纷。

　　如对裁决不服，可在法定期限内向人民法院提起诉讼。

　　4. 强调预防员工恶意劳动仲裁的发生

　　预防措施：

　　加强员工培训：提高员工的法律意识和职业道德水平，使其了解劳动仲裁的合法性和正当性。

　　建立监管机制：完善公司内部管理制度，加强对员工行为的监管和约束，防止恶意仲裁的发生。

　　规范合同管理：确保所有员工都签订书面劳动合同，明确双方的权利和义务，减少因合同问题引发的劳动纠纷。

　　5. 给出具体的法律建议和后续操作步骤

　　法律建议：

　　咨询专业律师：在面临员工恶意劳动仲裁时，公司应咨询专业律师的意见，获取专业的法律建议和代理服务。

　　保留证据：在整个处理过程中，公司应保留所有与仲裁相关的证据材料，以备不时之需。

　　后续操作步骤：

　　总结经验教训：每次处理完恶意劳动仲裁后，公司应总结经验教训，完善相关制度和流程，防止类似问题再次发生。

　　加强沟通：加强与员工之间的沟通，了解员工的需求和关切，及时解决问题，避免矛盾升级。

　　综上所述，公司在处理员工恶意劳动仲裁时，应识别具体原因、分析影响、采取针对性措施、加强预防并遵循法律建议进行操作。通过这些综合措施的实施，公司可以有效应对恶意劳动仲裁问题，维护自身合法权益和正常运营秩序。